Он изучал искусство в Академии изящных искусств и в Венской Академии художеств, а с 1916 года - член Венской академии, а также общества Альбрехта Дюрера.
Совершил образовательную поездку по Австрии и швейцарским Альпам. Алоис Арнеггер стал известен как художник-пейзажист. В 1920-х годах Арнеггер посетил Италию и был очарован ее прибрежными видами. С тех пор он рисовал яркие и красочные виды Капри, озеро Комо и Неаполь. Однако, после возвращения в Австрию, Арнеггер снова вернулся к живописи альпийских пейзажей с драматическим освещением.
Художник умер в Вене 11 августа 1967 года.